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公元1227年的8月25日，一代天骄成吉思汗在亲征西夏时去世，他在临死前将汗位传给了三子窝阔台，并且宣称就算窝阔台只有一个吃奶的孩子，都比其他人优先继承汗位。而成吉思汗去世后，蒙古人正忙于攻打西夏，因此窝阔台并没有直接登基，在窝阔台1229年登基之前的两年，成吉思汗的幼子拖雷一直以监国的名义掌握着帝国的权力。
成吉思汗的画像
在成吉思汗去世两年之后，蒙古贵族们在克鲁伦河畔举行了库里勒台大会，想要推举出大汗来继承成吉思汗的事业。而参加这次大会的蒙古贵族中，有一部分想要反对成吉思汗的遗嘱，他们认为应当恪守旧制，拥立幼子拖雷为新大汗。不过由于当时成吉思汗的长子术赤已死，作为二哥的察合台则坚决拥护窝阔台，并且带头向窝阔台行礼，于是窝阔台便成为了新的大汗。
而窝阔台之所以能顺利成为大汗，他的二哥察合台可谓是功不可没，因此窝阔台在登基之后，便一直和察合台保持着良好的关系，在成为大汗后仍然称呼察合台为兄长，并且在一些决策上都会听取察合台的意见。不过窝阔台毕竟是一位统治者，在面对一些威胁到自己权力的事务上，他仍然会坚决维护自己的“利益”。
窝阔台的画像
在成吉思汗西征结束后，曾将花剌子模王国东部的土地赐予察合台，这块位于中亚土地当时并没有被称呼为汗国，因为土地的所有权虽然属于察合台，但是实际的权力却牢牢掌握在窝阔台的手里。窝阔台在登基之后，立即便开始积极控制中亚，聪明的窝阔台明白，兄长察合台的封地对于蒙古帝国来说非常重要，中亚富饶的河中地区可是为帝国提供可观的税收，而且那里盛产的良马，也是蒙古骑兵的必需品。
而窝阔台之所以能牢牢控制中亚的土地，还要从成吉思汗结束西征后的一个策略说起。公元1224年，成吉思汗结束西征后，便任命回回人牙老瓦赤为河中地区的总督，让他管理河中地区的城镇，而牙老瓦赤也没有辜负成吉思汗的信任，在他的治理下，河中地区开始从蒙古军队的破坏中渐渐恢复过来，牙老瓦赤也成为了河中地区权力最大的人。
河中地区的城镇
因此在窝阔台登基之后，便立即和牙老瓦赤取得了联系，聪明的牙老瓦赤也选择向窝阔台效忠，他本人则成为了窝阔台统治中亚的代理人。而当时的察合台，一直和自己的手下生活在中亚东部的草原上，他只能控制自己的军队，却无法干预河中地区的城镇。不久之后，察合台便开始和牙老瓦赤发生矛盾，在1238年的时候，布哈拉的制筛匠塔剌发动反抗蒙古人的起义，察合台见状便派军前去镇压，并且在平定起义之后，想要按照惯例对布哈拉进行屠城。
可是就在这个时候，牙老瓦赤却站了出来，他反对察合台屠杀布哈拉居民，并且将此事报告给了窝阔台，结果窝阔台果断的支持了牙老瓦赤，并且要求察合台不准屠城。这件事结束不久后，察合台便开始不断针对牙老瓦赤，他曾未和牙老瓦赤商量，就将阿姆河北部的一片土地赏赐给自己的部下，牙老瓦赤得知此事后，便再次上报窝阔台，结果窝阔台勃然大怒，并且对察合台提出了批评，察合台见状也只好认错。
察合台的画像
不过后来窝阔台为了安抚兄长察合台，还是将那块土地赐予了察合台。不过这件事也使察合台和牙老瓦赤的矛盾彻底激化，察合台开始迁怒于牙老瓦赤，而牙老瓦赤也并不相让，甚至曾以窝阔台的名义来威胁察合台的大臣。在窝阔台活着的时候，仅仅依靠一个牙老瓦赤，就牢牢控制了中亚的土地，因此曾有中亚的史学家认为窝阔台的这个方法非常高明。
公元1241年察合台去世后，为了防止支持察合台的贵族报复牙老瓦赤，窝阔台立即将牙老瓦赤召回到中原，并且任命牙老瓦赤的儿子担任河中总督。牙老瓦赤前往中原后不久，窝阔台便去世了，而牙老瓦赤因为和另一位回回权臣奥都剌合蛮不和而被窝阔台的妻子乃马真皇后排挤，直到贵由汗登基之后，牙老瓦赤才重新被重用。
